集成是电子病历发展中要考虑的重要问题。在内容上、病历信息来自于多个不同的系统，甚至是不同厂商的系统，病历的内容又在不断发展变化，这些内容要集成到一起；在外观上，希望能够将病历信息的外观与其内容集成到一起。

电子病历研究的一个重要方面是专科、表格或结构化病历的处理问题。随着病历内容覆盖越来越多，结构化的内容会越来越多，结构化程度会不断细化。电子病历系统的设计必须考虑这一发展要求，能随时将新出现的结构化内容集成到病历中来。采用XML为这种发展创造了条件。以检查报告为例，心脏超声与腹部超声的报告格式就不会相同。在数据库方式下，将检查报告抽象为一种统一的结构，不能体现各类报告的区别，而在XML下，它们可以对应不同的DTD。新出现的报告形式在设计阶段是不能预见的，但却能容易地集成到系统中来而无须修改已有的软件。

另外一点，信息系统的发展必然要走集成的道路，有第三方的系统所产生的病人信息。如果它也是XML的或者可以转为XML的，这部分内容也要集成到电子病历中来。

这些是病历内容上的集成。内容上的集成可以通过DTD的集成来实现。不同时期可以采用不同的DTD。在传统方式下，要解决这一问题只能依靠修改应用程序来实现。

集成的另一方面是内容与外观的集成。当病历信息在浏览器中显示时，需要规定显示的样式。不同类型的内容采用不同的样式，同类内容也可能采用不同的样式。如：不同科室的检查检验报告，可能希望不同的显示样式。而样式本身又可能随着时间的发展而变化。我们希望样式能与内容一样保存起来，展现病历内容时使用原有样式。这就是内容与外观的集成。我们可以通过两方面的工作实现这一需求：一方面在XML中，与样式描述相关联，另一方面，要在存储管理XML内容的同时，管理DTD和样式描述，并将其与内容相关联。这由存储管理程序实现。